El sueldo de Cubillos en la USS pagaba algo distinto de la docencia: formaba parte de un plan político ligado a su candidatura, lo que reabre el tema del financiamiento irregular de la política.
Cubillos fue candidata a alcaldesa de Las Condes y perdió el 27 de octubre de 2024. La Fiscalía Centro Norte y la Superintendencia de Educación Superior abrieron investigaciones por el sueldo, pero no se encontró una resolución que acredite que el pago tuviera un fin político.
En septiembre de 2024 se reveló que la USS pagaba a Cubillos unos 17 millones de pesos brutos mensuales (cerca de 11 millones líquidos) por un contrato vigente entre 2020 y 2024. La Superintendencia de Educación Superior abrió una investigación contra la universidad.
(provisional) Una denuncia ante la Superintendencia señaló que Cubillos no figuraba en el sistema nacional de investigación, pese a que su contrato contemplaba labores de investigación. No se verificó qué editorial publicó sus libros.