El sueldo de 17 millones de pesos mensuales que la Universidad San Sebastián pagaba a Marcela Cubillos no tiene equivalente en el mundo académico chileno.
En septiembre de 2024 se reveló que la USS pagaba a Cubillos unos 17 millones de pesos brutos mensuales (cerca de 11 millones líquidos) por un contrato vigente entre 2020 y 2024. La Superintendencia de Educación Superior abrió una investigación contra la universidad.